По умолчанию локальная архивация на сервере отключена.
Для очистки почтового ящика нужно выполнить несколько действий:
2. Далее "Инструменты", далее "Удалять старые элементы"

3. Далее настроить папку для локального архива.
4. В архиве создаём нужные папки и перетягиваем туда письма которые нужно заархивировать чтоб освободить место на сервере.

Готово.